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Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  49 lines
  1. **********************************************
  2. * Inositol monophosphatase family signatures *
  3. **********************************************
  4.  
  5. It has been shown [1] that several proteins share two sequence motifs.  Two of
  6. these  proteins  are  enzymes  of  the  inositol  phosphate  second  messenger
  7. signalling pathway:
  8.  
  9.  - Vertebrate inositol monophosphatase (EC 3.1.3.25).
  10.  - Vertebrate inositol polyphosphate 1-phosphatase (EC 3.1.3.57).
  11.  
  12. The function of the other proteins is not yet clear:
  13.  
  14.  - Escherichia coli protein cysQ. CysQ could  help  control  the  pool of PAPS
  15.    (3'-phosphoadenoside 5'-phosphosulfate), or be useful in sulfite synthesis.
  16.  - Escherichia coli protein suhB.  Mutations  in  suhB results in the enhanced
  17.    synthesis of heat shock sigma factor (htpR).
  18.  - Neurospora crassa protein Qa-X. Probably involved in quinate metabolism.
  19.  - Emericella nidulans protein qutG. Probably involved in quinate metabolism.
  20.  - Yeast  protein  HAL2/MET22  [2]  involved  in  salt  tolerance  as  well as
  21.    methionine biosynthesis.
  22.  - A Rhizobium leguminosarum hypothetical protein encoded  upstream of the pss
  23.    gene for exopolysaccharide synthesis.
  24.  
  25. It is suggested [1] that these proteins may  act by enhancing the synthesis or
  26. degradation of phosphorylated messenger molecules. From the X-ray structure of
  27. human  inositol monophosphatase [3], it  seems  that  some  of  the  conserved
  28. residues are involved in binding a metal ion and/or the phosphate group of the
  29. substrate.
  30.  
  31. -Consensus pattern: W-x(0,1)-[LIVM]-D-P-[LIVM]-D-[SG]-T-x(2)-[FY]-x-[HKR]
  32.                     [The first D and the T bind a metal ion]
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  35.  
  36. -Consensus pattern: W-D-x(2)-[GA](2)-x-[LIVMAN]-[LIVMA](2)-x(3)-[GA](2)
  37. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  38. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  39.  
  40. -Last update: October 1993 / Patterns and text revised.
  41.  
  42. [ 1] Neuwald A.F., York J.D., Majerus P.W.
  43.      FEBS Lett. 294:16-18(1991).
  44. [ 2] Glaeser H.-U., Thomas D., Gaxiola R., Montrichard F., Surdin-Kerjan Y.,
  45.      Serrano R.
  46.      EMBO J. 12:3105-3110(1993).
  47. [ 3] Bone R., Springer J.P., Atack J.R.
  48.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89:10031-10035(1992).
  49.